За рішенням Віктора Ющенка, до компетенції Секретаріату Президента від РНБО відходять, зокрема, внесення кандидатур на посади в правоохоронних органах, збройних силах та інших військових формуваннях.
Секретаріат також опікуватиметься суддями та членами Вищої ради юстиції.
Секретаріат також опікуватиметься суддями та членами Вищої ради юстиції.